Jupyter Notebook is an open-source web application that allows you to create and share documents that contain live code, equations, visualizations, and narrative text. Uses include data cleaning and transformation, numerical simulation, statistical modeling, data visualization, machine learning, and much more.
Jupyter has support for over 40 different programming languages and Python is one of them. Python is a requirement (Python 3.3 or greater, or Python 2.7) for installing the Jupyter Notebook itself.
Jupyter Notebook can be installed by using either of the two ways described below:
- Using Anaconda:
Install Python and Jupyter using the Anaconda Distribution, which includes Python, the Jupyter Notebook, and other commonly used packages for scientific computing and data science. To install Anaconda, go through How to install Anaconda on windows? and follow the instructions provided. -
Using PIP:
Install Jupyter using the PIP package manager used to install and manage software packages/libraries written in Python. To install pip, go through How to install PIP on Windows? and follow the instructions provided.
Installing Jupyter Notebook using Anaconda:
Anaconda is an open-source software that contains Jupyter, spyder, etc that are used for large data processing, data analytics, heavy scientific computing. Anaconda works for R and python programming language. Spyder(sub-application of Anaconda) is used for python. Opencv for python will work in spyder. Package versions are managed by the package management system called conda.
To install Jupyter using Anaconda, just go through the following instructions:
Launching Jupyter:
Installing Jupyter Notebook using pip:
PIP is a package management system used to install and manage software packages/libraries written in Python. These files are stored in a large “on-line repository” termed as Python Package Index (PyPI).
pip uses PyPI as the default source for packages and their dependencies.
To install Jupyter using pip, we need to first check if pip is updated in our system. Use the following command to update pip:
python -m pip install --upgrade pip
After updating the pip version, follow the instructions provided below to install Jupyter:
- Command to install Jupyter:
python -m pip install jupyter
- Beginning Installation:
- Downloading Files and Data:
- Installing Packages:
- Finished Installation:
Launching Jupyter:
Use the following command to launch Jupyter using command-line:
jupyter notebook
Jupyter Notebook is an open-source web application that allows you to create and share documents that contain live code, equations, visualizations, and narrative text. Uses include data cleaning and transformation, numerical simulation, statistical modeling, data visualization, machine learning, and much more.
Jupyter has support for over 40 different programming languages and Python is one of them. Python is a requirement (Python 3.3 or greater, or Python 2.7) for installing the Jupyter Notebook itself.
Jupyter Notebook can be installed by using either of the two ways described below:
- Using Anaconda:
Install Python and Jupyter using the Anaconda Distribution, which includes Python, the Jupyter Notebook, and other commonly used packages for scientific computing and data science. To install Anaconda, go through How to install Anaconda on windows? and follow the instructions provided. -
Using PIP:
Install Jupyter using the PIP package manager used to install and manage software packages/libraries written in Python. To install pip, go through How to install PIP on Windows? and follow the instructions provided.
Installing Jupyter Notebook using Anaconda:
Anaconda is an open-source software that contains Jupyter, spyder, etc that are used for large data processing, data analytics, heavy scientific computing. Anaconda works for R and python programming language. Spyder(sub-application of Anaconda) is used for python. Opencv for python will work in spyder. Package versions are managed by the package management system called conda.
To install Jupyter using Anaconda, just go through the following instructions:
Launching Jupyter:
Installing Jupyter Notebook using pip:
PIP is a package management system used to install and manage software packages/libraries written in Python. These files are stored in a large “on-line repository” termed as Python Package Index (PyPI).
pip uses PyPI as the default source for packages and their dependencies.
To install Jupyter using pip, we need to first check if pip is updated in our system. Use the following command to update pip:
python -m pip install --upgrade pip
After updating the pip version, follow the instructions provided below to install Jupyter:
- Command to install Jupyter:
python -m pip install jupyter
- Beginning Installation:
- Downloading Files and Data:
- Installing Packages:
- Finished Installation:
Launching Jupyter:
Use the following command to launch Jupyter using command-line:
jupyter notebook
Все курсы > Программирование на Питоне > Занятие 14
Программа Jupyter Notebook — это локальная программа, которая открывается в браузере и позволяет интерактивно исполнять код на Питоне, записанный в последовательности ячеек.
Облачной версией Jupyter Notobook является программа Google Colab, которой мы уже давно пользуемся на курсах машинного обучения. Если вы проходили мои занятия, то в работе с этой программой для вас не будет почти ничего нового.
Способ 1. Если на вашем компьютере уже установлен Питон, то установить Jupyter Notebook можно через менеджер пакетов pip.
Способ 2 (рекомендуется). Кроме того, Jupyter Notebook входит в дистрибутив Питона под названием Anaconda.
На сегодняшнем занятии мы рассмотрим именно второй вариант установки.
Anaconda
Anaconda — это дистрибутив Питона и репозиторий пакетов, специально предназначенных для анализа данных и машинного обучения.
Основу дистрибутива Anaconda составляет система управления пакетами и окружениями conda.
Conda можно управлять двумя способами, а именно через Anaconda Prompt — программу, аналогичную командной строке Windows, или через Anaconda Navigator — понятный графический интерфейс.
Кроме того, в дистрибутив Anaconda входит несколько полезных программ:
- Jupyter Notebook и JupyterLab — это программы, позволяющие исполнять код на Питоне (и, как мы увидим, на других языках) и обрабатывать данные.
- Spyder и PyCharm представляют собой так называемую интегрированную среду разработки (Integrated Development Environment, IDE). IDE — это редактор кода наподобие программы Atom или Sublime Text с дополнительными возможностями автодополнения, компиляции и интерпретации, анализа ошибок, отладки (debugging), подключения к базам данных и др.
- RStudio — интегрированная среда разработки для программирования на R.
На схеме структура Anaconda выглядит следующим образом:
Установка дистрибутива Anaconda на Windows
Шаг 1. Скачайте Anaconda⧉ с официального сайта.
Шаг 2. Запустите установщик.
На одном из шагов установки вам предложат поставить две галочки, в частности (1) добавить Anaconda в переменную path и (2) сделать дистрибутив Anaconda версией, которую Windows обнаруживает по умолчанию.
Не отмечайте ни один из пунктов!
Так вы сможете использовать два дистрибутива Питона, первый дистрибутив мы установили на прошлом занятии, второй — сейчас.
Как запустить Jupyter Notebook
После того как вы скачали и установили Anaconda, можно переходить к запуску ноутбука.
Шаг 1. Откройте Anaconda Navidator
Открыть Anaconda Navigator можно двумя способами.
Способ 1. Запуск из меню «Пуск». Просто перейдите в меню «Пуск» и выберите Anaconda Navigator.
Способ 2. Запуск через Anaconda Prompt. Также из меню «Пуск» откройте терминал Anaconda Prompt.
Введите команду
anaconda-navigator.
В результате должно появиться вот такое окно.
Шаг 2. Откройте Jupyter Notebook
Теперь выберите Jupyter Notebook и нажмите Launch («Запустить»).
Замечу, что Jupyter Notebook можно открыть не только из Anaconda Navigator, но и через меню «Пуск», а также введя в терминале Anaconda Prompt команду
jupyter-notebook.
В результате должен запуститься локальный сервер, и в браузере откроется перечень папок вашего компьютера.
Шаг 3. Выберите папку и создайте ноутбук
Выберите папку, в которой хотите создать ноутбук. В моем случае я выберу Рабочий стол (Desktop).
Теперь в правом верхнем углу нажмите New → Python 3.
Мы готовы писать и исполнять код точно также, как мы это делаем в Google Colab.
Импортируем библиотеку Numpy и создадим массив.
Шаг 4. Сохраните ноутбук и закройте Jupyter Notebook
Переименуйте ноутбук в mynotebook (для этого, как и в Google Colab, отредактируйте само название непосредственно в окне ноутбука). Сохранить файл можно через File → Save and Checkpoint.
Обратите внимание, помимо файла mynotebook.ipynb, Jupyter Notebook создал скрытую папку .ipynb_checkpoints. В ней хранятся файлы, которые позволяют вернуться к предыдущей сохраненной версии ноутбука (предыдущему check point). Сделать это можно, нажав File → Revert to Checkpoint и выбрав дату и время предыдущей сохраненной версии кода.
Когда вы закончили работу, закройте вкладку с ноутбуком. Остается прервать работу локального сервера, нажав Quit в правом верхнем углу.
Особенности работы
Давайте подробнее поговорим про возможности Jupyter Notebook. Снова запустим только что созданный ноутбук любым удобным способом.
Код на Python
В целом мы пишем обычный код на Питоне.
Вкладка Cell
Для управления запуском или исполнением ячеек можно использовать вкладку Cell.
Здесь мы можем, в частности:
- Запускать ячейку и оставаться в ней же через Run Cells
- Исполнять все ячейки в ноутбуке, выбрав Run All
- Исполнять все ячейки выше (Run All Above) или ниже текущей (Run All Below)
- Очистить вывод ячеек, нажав All Output → Clear
Вкладка Kernel
Командами вкладки Kernel мы управляем ядром (kernel) или вычислительным «движком» ноутбука.
В этой вкладке мы можем, в частности:
- Прервать исполнение ячейки командой Interrupt. Это бывает полезно, если, например, исполнение кода занимает слишком много времени или в коде есть ошибка и исполнение кода не прервется самостоятельно.
- Перезапустить kernel можно командой Restart. Кроме того, можно
- очистить вывод (Restart & Clear Output) и
- заново запустить все ячейки (Restart & Run All)
Несколько слов про то, что такое ядро и как в целом функционирует Jupyter Notebook.
Пользователь взаимодействует с ноутбуком через браузер. Браузер в свою очередь отправляет запросы на сервер. Функция сервера заключается в том, чтобы загружать ноутбук и сохранять внесенные изменения в формате JSON с расширением .ipynb. Одновременно, сервер обращается к ядру в тот момент, когда необходимо обработать код на каком-либо языке (например, на Питоне).
Такое «разделение труда» между браузером, сервером и ядром позволяет во-первых, запускать Jupyter Notebook в любой операционной системе, во-вторых, в одной программе исполнять код на нескольких языках, и в-третьих, сохранять результат в файлах одного и того же формата.
Возможность программирования на нескольких языках (а значит использование нескольких ядер) мы изучим чуть позже, а пока посмотрим как устанавливать новые пакеты для Питона внутри Jupyter Notebook.
Установка новых пакетов
Установить новые пакеты в Anaconda можно непосредственно в ячейке, введя
!pip install <package_name>. Например, попробуем установить Numpy.
Система сообщила нам, что такой пакет уже установлен. Более того, мы видим путь к папке внутри дистрибутива Anaconda, в которой Jupyter «нашел» Numpy.
При подготовке этого занятия я использовал два компьютера, поэтому имя пользователя на скриншотах указано как user или dmvma. На вашем компьютере при указании пути к файлу используйте ваше имя пользователя.
В последующих разделах мы рассмотрим дополнительные возможности по установке пакетов через Anaconda Prompt и Anaconda Navigator.
По ссылке ниже вы можете скачать код, который мы создали в Jupyter Notebook.
Два Питона на одном компьютере
Обращу ваше внимание, что на данный момент на моем компьютере (как и у вас, если вы проделали шаги прошлого занятия) установлено два Питона, один с сайта www.python.org⧉, второй — в составе дистрибутива Anaconda.
Посмотреть на установленные на компьютеры «Питоны» можно, набрав команду
where python в Anaconda Prompt.
Указав полный или абсолютный путь (absolute path) к каждому из файлов python.exe, мы можем в интерактивном режиме исполнять код на версии 3.8 (установили с www.python.org) и на версии 3.10 (установили в составе Anaconda). При запуске файла python.exe из папки WindowsApps система предложит установить Питон из Microsoft Store.
В этом смысле нужно быть аккуратным и понимать, какой именно Питон вы используете и куда устанавливаете очередной пакет.
В нашем случае мы настроили работу так, чтобы устанавливать библиотеки для Питона с www.python.org через командную строку Windows, и устанавливать пакеты в Анаконду через Anaconda Prompt.
Убедиться в этом можно, проверив версии Питона через
python —version в обеих программах.
Теперь попробуйте ввести в них команду
pip list и сравнить установленные библиотеки.
Markdown в Jupyter Notebook
Вернемся к Jupyter Notebook. Помимо ячеек с кодом, можно использовать текстовые ячейки, в которых поддерживается язык разметки Markdown. Мы уже коротко рассмотрели этот язык на прошлом занятии, когда создавали пакет на Питоне.
По большому счету, с помощью несложных команд Markdown, вы говорите Jupyter как отформатировать ту или иную часть текста.
Рассмотрим несколько основных возможностей форматирования (для удобстства и в силу практически полного совпадения два последующих раздела приведены в ноутбуке Google Colab).
Откроем ноутбук к этому занятию⧉
Заголовки
Заголовки создаются с помощью символа решетки.
# Заголовок 1 ## Заголовок 2 ### Заголовок 3 #### Заголовок 4 ##### Заголовок 5 ###### Заголовок 6 |
Если перед первым символом решетки поставить знак , Markdown просто выведет символы решетки.
Абзацы
Абзацы отделяются друг от друга пробелами.
Мы также можем разделять абзацы прямой линией.
Выделение текста
**Полужирный стиль** *Курсив* ~~Перечеркнутый стиль~~ |
Форматирование кода и выделенные абзацы
Мы можем выделять код внутри строки или отдельным абзацем.
Отформатируем код `print(‘Hello world!’)` внутри строки и отдельным абзацем «` print(‘Hello world!’) «` |
Возможно выделение и текстовых абзацев ( так называемые blockquotes).
> Markdown позволяет форматировать текст без использования тэгов. > > Он был создан в 2004 году Джоном Грубером и Аароном Шварцем. |
Списки
Посмотрим на создание упорядоченных и неупорядоченных списков.
**Упорядоченный список** 1. Пункт 1 1. Пункт 2 (нумерация ведется автоматически) **Неупорядоченный список** * Пункт 1.1 * Пункт 2.1 * Пункт 2.2 * Пункт 3.1 * Пункт 3.2 * Пункт 1.2 |
Ссылки и изображения
Текст ссылки заключается в квадратные скобки, сама ссылка — в круглые.
[сайт проекта Jupyter](https://jupyter.org/) |
Изображение форматируется похожим образом.
![логотипы Jupyter и Python](https://www.dmitrymakarov.ru/wp-content/uploads/2022/05/jupyter-python.jpeg) |
Таблицы
| id | item | price | |— |———-| ——| | 01 | pen | 200 | | 02 | pencil | 150 | | 03 | notebook | 300 | |
Таблицы для Markdown бывает удобно создавать с помощью специального инструмента⧉.
Формулы на LaTeX
В текстовых полях можно вставлять формулы и математические символы с помощью системы верстки, которая называется LaTeX (произносится «латэк»). Они заключаются в одинарные или двойные символы $.
Если использовать одинарный символ $, то расположенная внутри формула останется в пределах того же абзаца. Например, запись
$ y = x^2 $ даст $ y = x^2 $.
В то время как
$$ y = x^2 $$ поместит формулу в новый абзац.
$$ y = x^2 $$
Одинарный символ добавляет пробел. Двойной символ \ переводит текст на новую строку.
$$ hat{y} = theta_0 + theta_1 x_1 + theta_2 x_2 + ... + theta_n x_n $$ |
Рассмотрим некоторые элементы синтаксиса LaTeX.
Форматирование текста
$ text{just text} $ $ textbf{bold} $ $ textit{italic} $ $ underline{undeline} $ |
Надстрочные и подстрочные знаки
hat $ hat{x} $ bar $ bar{x} $ vector $ vec{x} $ tilde $ tilde{x} $ superscript $ e^{ax + b} $ subscript $ A_{i, j} $ degree $ 90^{circ} $ |
Скобки
Вначале рассмотрим код для скобок в пределах высоты строки.
$$ (a+b) [a+b] {a+b} langle x+y rangle |x+y| |x+y| $$ |
Кроме того, с помощью
left(,
right), а также
left[,
right] и так далее можно увеличить высоту скобки. Сравните.
$$ left(frac{1}{2}right) qquad (frac{1}{2}) $$ |
Также можно использовать отдельные команды для скобок различного размера.
$$ big( Big( bigg( Bigg( big] Big] bigg] Bigg] big{ Big{ bigg{ Bigg{ $$ |
Дробь и квадратный корень
fraction $$ frac{1}{1+e^{—z}} $$ square root $ sqrt{sigma^2} $ |
Греческие буквы
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 |
|Uppercase | LaTeX |Lowercase | LaTeX | RU | |————— |———— |————— |———— |———— | |————— |———— |$alpha$ |alpha | альфа | |————— |———— |$beta$ |beta | бета | |$Gamma$ |Gamma |$gamma$ |gamma | гамма | |$Delta$ |Delta |$delta$ |delta | дельта | |————— |———— |$epsilon$ |epsilon | эпсилон | |————— |———— |$varepsilon$ |varepsilon | ———— | |————— |———— |$zeta$ |zeta | дзета | |————— |———— |$eta$ |eta | эта | |$Theta$ |Theta |$theta$ |theta | тета | |————— |———— |$vartheta$ |vartheta | ———— | |————— |———— |$iota$ |iota | йота | |————— |———— |$kappa$ |kappa | каппа | |$Lambda$ |Lambda |$lambda$ |lambda | лямбда | |————— |———— |$mu$ |mu | мю | |————— |———— |$nu$ |nu | ню | |$Xi$ |Xi |$xi$ |xi | кси | |————— |———— |$omicron$ |omicron | омикрон | |$Pi$ |Pi |$pi$ |pi | пи | |————— |———— |$varpi$ |varpi | ———— | |————— |———— |$rho$ |rho | ро | |————— |———— |$varrho$ |varrho | ———— | |$Sigma$ |Sigma |$sigma$ |sigma | сигма | |————— |———— |$varsigma$ |varsigma | ———— | |————— |———— |$tau$ |tau | тау | |$Upsilon$ |Upsilon |$upsilon$ |upsilon | ипсилон | |$Phi$ |Phi |$phi$ |phi | фи | |————— |———— |$varphi$ |varphi | ———— | |————— |———— |$chi$ |chi | хи | |$Psi$ |Psi |$psi$ |psi | пси | |$Omega$ |Omega |$omega$ |omega | омега | |
Латинские обозначения
$$ sin(—alpha) = —sin(alpha) cos(theta)=sin left( frac{pi}{2}—theta right) tan(x) = frac{sin(x)}{cos(x)} log_b(1) = 0 $$ |
Логические символы и символы множества
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 |
| LaTeX | symbol | | ——————————— | ————————————— | |Rightarrow | $ Rightarrow $ | |rightarrow | $ rightarrow $ | |longleftrightarrow | $ Leftrightarrow $ | |cap | $ cap $ | |cup | $ cup $ | |subset | $ subset $ | |in | $ in $ | |notin | $ notin $ | |varnothing | $ varnothing $ | |neg | $ neg $ | |forall | $ forall $ | |exists | $ exists $ | |mathbb{N} | $ mathbb{N} $ | |mathbb{Z} | $ mathbb{Z} $ | |mathbb{Q} | $ mathbb{Q} $ | |mathbb{R} | $ mathbb{R} $ | |mathbb{C} | $ mathbb{C} $ | |
Другие символы
| LaTeX | symbol | | ——————————— | ————————————— | | < | $ < $ | | leq | $ leq $ | | > | $ geq $ | | neq | $ neq $ | | approx | $ approx $ | | angle | $ angle $ | | parallel | $ parallel $ | | pm | $ pm $ | | mp | $ mp $ | | cdot | $ cdot $ | | times | $ times $ | | div | $ div $ | |
Кусочная функция и система уравнений
Посмотрим на запись функции sgn (sign function) средствами LaTeX.
$$ sgn(x) = left{ begin{array} 1 & mbox{if } x in mathbf{N}^* 0 & mbox{if } x = 0 —1 & mbox{else.} end{array} right. $$ |
Схожим образом записывается система линейных уравнений.
$$ left{ begin{matrix} 4x + 3y = 20 —5x + 9y = 26 end{matrix} right. $$ |
Горизонтальная фигурная скобка
$$ overbrace{ underbrace{a}_{real} + underbrace{b}_{imaginary} i} ^{textit{complex number}} $$ |
Предел, производная, интеграл
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 |
Пределы: $$ lim_{x to +infty} f(x) $$ $$ lim_{x to —infty} f(x) $$ $$ lim_{x to с} f(x) $$ Производная (нотация Лагранжа): $$ f‘(x) $$ Частная производная (нотация Лейбница): $$ frac{partial f}{partial x} $$ Градиент: $$ nabla f(x_1, x_2) = begin{bmatrix} frac{partial f}{partial x_1} frac{partial f}{partial x_2} end{bmatrix} $$ Интеграл: $$int_{a}^b f(x)dx$$ |
Сумма и произведение
Сумма: $$ sumlimits_{i=1}^n a_{i} $$ $$sum_{i=1}^n a_{i} $$ Произведение: $$prod_{j=1}^m a_{j}$$ |
Матрица
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 |
Без скобок (plain): $$ begin{matrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{matrix} $$ Круглые скобки (parentheses, round brackets): $$ begin{pmatrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{pmatrix} $$ Квадратные скобки (square brackets): $$ begin{bmatrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{bmatrix} $$ Фигурные скобки (curly brackets, braces): $$ begin{Bmatrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{Bmatrix} $$ Прямые скобки (pipes): $$ begin{vmatrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{vmatrix} $$ Двойные прямые скобки (double pipes): $$ begin{Vmatrix} 1 & 2 & 3 a & b & c end{Vmatrix} $$ |
Программирование на R
Jupyter Notebook позволяет писать код на других языках программирования, не только на Питоне. Попробуем написать и исполнить код на R, языке, который специально разрабатывался для data science.
Вначале нам понадобится установить kernel для R. Откроем Anaconda Prompt и введем следующую команду
conda install -c r r-irkernel. В процессе установки система спросит продолжать или нет (Proceed ([y]/n)?). Нажмите y + Enter.
Откройте Jupyter Notebook. В списке файлов создайте ноутбук на R. Назовем его rprogramming.
После установки нового ядра и создания еще одного файла .ipynb схема работы нашего Jupyter Notebook немного изменилась.
Теперь мы готовы писать код на R. Мы уже начали знакомиться с этим языком, когда изучали парадигмы программирования. Сегодня мы рассмотрим основные типы данных и особенности синтаксиса.
Переменные в R
Числовые, строковые и логические переменные
Как и в Питоне, в R мы можем создавать числовые (numeric), строковые (character) и логические (logical) переменные.
# поместим число 42 в переменную numeric_var numeric_var = 42 # строку поместим в переменную text_var text_var <— ‘Hello world!’ # наконец присвоим значение TRUE переменной logical_var TRUE -> logical_var |
Для присвоения значений можно использовать как оператор
=, так и операторы присваивания
<— и
->. Обратите внимание, используя
-> мы можем поместить значение слева, а переменную справа.
Посмотрим на результат (в Jupyter Notebook можно обойтись без функции print()).
Выведем класс созданных нами объектов с помощью функции class().
class(numeric_var) class(text_var) class(logical_var) |
‘numeric’ ‘character’ ‘logical’ |
Тип данных можно посмотреть с помощью функции typeof().
typeof(numeric_var) typeof(text_var) typeof(logical_var) |
‘double’ ‘character’ ‘logical’ |
Хотя вывод этих функций очень похож, мы, тем не менее, видим, что классу numeric соответствует тип данных double (число с плавающей точкой с двумя знаками после запятой).
Числовые переменные: numeric, double, integer
По умолчанию, в R и целые числа, и дроби хранятся в формате double.
# еще раз поместим число 42 в переменную numeric_var numeric_var <— 42 # выведем тип данных typeof(numeric_var) |
Принудительно перевести 42 в целочисленное значение можно с помощью функции as.integer().
int_var <— as.integer(numeric_var) typeof(int_var) |
Кроме того, если после числа поставить L, это число автоматически превратится в integer.
Превратить integer обратно в double можно с помощью функций as.double() и as.numeric().
typeof(as.double(int_var)) typeof(as.numeric(42L)) |
Если число хранится в формате строки, его можно перевести обратно в число (integer или double).
text_var <— ’42’ typeof(text_var) |
typeof(as.numeric(text_var)) # можно также использовать as.double() typeof(as.integer(text_var)) |
Вектор
Вектор (vector) — это одномерная структура, которая может содержать множество элементов одного типа. Вектор можно создать с помощью функции c().
# создадим вектор с информацией о продажах товара в магазине за неделю (в тыс. рублей) sales <— c(24, 28, 32, 25, 30, 31, 29) sales |
С помощью функций length() и typeof() мы можем посмотреть соответственно общее количество элементов и тип данных каждого из них.
# посмотрим на общее количество элементов и тип данных каждого из них length(sales) typeof(sales) |
У вектора есть индекс, который (в отличие, например, от списков в Питоне), начинается с единицы.
При указании диапазона выводятся и первый, и последний его элементы.
Отрицательный индекс убирает элементы из вектора.
Именованный вектор (named vector) создается с помощью функции names().
# создадим еще один вектор с названиями дней недели days_vector <— c(‘Понедельник’, ‘Вторник’, ‘Среда’, ‘Четверг’, ‘Пятница’, ‘Суббота’, ‘Воскресенье’) days_vector |
‘Понедельник’ ‘Вторник’ ‘Среда’ ‘Четверг’ ‘Пятница’ ‘Суббота’ ‘Воскресенье’ |
# создадим именованный вектор с помощью функции names() names(sales) <— days_vector sales |
Выводить элементы именованного вектора можно не только по числовому индексу, но и по их названиям.
Список
В отличие от вектора, список (list) может содержать множество элементов различных типов.
# список создается с помощью функции list() list(‘DS’, ‘ML’, c(21, 24), c(TRUE, FALSE), 42.0) |
[[1]] [1] «DS» [[2]] [1] «ML» [[3]] [1] 21 24 [[4]] [1] TRUE FALSE [[5]] [1] 42 |
Матрица
Матрица (matrix) в R — это двумерная структура, содержащая одинаковый тип данных (чаще всего числовой). Матрица создается с помощью функции matrix() с параметрами data, nrow, ncol и byrow.
- data — данные для создания матрицы
- nrow и ncol — количество строк и столбцов
- byrow — параметр, указывающий заполнять ли элементы матрицы построчно (TRUE) или по столбцам (FALSE)
Рассмотрим несколько примеров. Cоздадим последовательность целых чисел (по сути, тоже вектор).
# для этого подойдет функция seq() sqn <— seq(1:9) sqn typeof(sqn) |
1 2 3 4 5 6 7 8 9 ‘integer’ |
Используем эту последовательность для создания двух матриц.
# создадим матрицу, заполняя значения построчно mtx <— matrix(sqn, nrow = 3, ncol = 3, byrow = TRUE) mtx |
# теперь создадим матрицу, заполняя значения по столбцам mtx <— matrix(sqn, nrow = 3, ncol = 3, byrow = FALSE) mtx |
Зададим названия для строк и столбцов второй матрицы.
# создадим два вектора с названиями строк и столбцов rows <— c(‘Row 1’, ‘Row 2’, ‘Row 3’) cols <— c(‘Col 1’, ‘Col 2’, ‘Col 3’) # используем функции rownames() и colnames(), # чтобы передать эти названия нашей матрице rownames(mtx) <— rows colnames(mtx) <— cols # посмотрим на результат mtx |
Посмотрим на размерность этой матрицы с помощью функции dim().
Массив
В отличие от матрицы, массив (array) — это многомерная структура. Создадим трехмерный массив размерностью 3 х 2 х 3. Вначале создадим три матрицы размером 3 х 2.
# создадим три матрицы размером 3 х 2, # заполненные пятерками, шестерками и семерками a <— matrix(5, 3, 2) b <— matrix(6, 3, 2) c <— matrix(7, 3, 2) |
Теперь соединим их с помощью функции array(). Передадим этой функции два параметра в форме векторов: данные (data) и размерность (dim).
arr <— array(data = c(a, b, c), # вектор с матрицами dim = c(3, 2, 3)) # вектор размерности print(arr) |
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 |
, , 1 [,1] [,2] [1,] 5 5 [2,] 5 5 [3,] 5 5 , , 2 [,1] [,2] [1,] 6 6 [2,] 6 6 [3,] 6 6 , , 3 [,1] [,2] [1,] 7 7 [2,] 7 7 [3,] 7 7 |
Факторная переменная
Факторная переменная или фактор (factor) — специальная структура для хранения категориальных данных. Вначале немного теории.
Как мы узнаем на курсе анализа данных, категориальные данные бывают номинальными и порядковыми. Номинальные категориальные (nominal categorical) данные представлены категориями, в которых нет естественного внутреннего порядка. Например, пол или цвет волос человека, марка автомобиля могут быть отнесены к определенным категориям, но не могут быть упорядочены.
Порядковые категориальные (ordinal categorical) данные наоборот обладают внутренним, свойственным им порядком. К таким данным относятся шкала удовлетворенности потребителей, класс железнодорожного билета, должность или звание, а также любая количественная переменная, разбитая на категории (например, низкий, средний и высокий уровень зарплат).
Посмотрим, как учесть такие данные с помощью R. Начнем с номинальных данных.
# предположим, что мы собрали данные о цветах нескольких автомобилей и поместили их в вектор color_vector <— c(‘blue’, ‘blue’, ‘white’, ‘black’, ‘yellow’, ‘white’, ‘white’) # преобразуем этот вектор в фактор с помощью функции factor() factor_color <— factor(color_vector) factor_color |
Как вы видите, функция factor() разбила данные на категории, при этом эти категории остались неупорядоченными. Посмотрим на класс созданного объекта.
Теперь поработаем с порядковыми данными.
# возьмем данные измерений температуры, выраженные категориями temperature_vector <— c(‘High’, ‘Low’, ‘High’,‘Low’, ‘Medium’, ‘High’, ‘Low’) # создадим фактор factor_temperature <— factor(temperature_vector, # указав параметр order = TRUE order = TRUE, # а также вектор упорядоченных категорий levels = c(‘Low’, ‘Medium’, ‘High’)) # посмотрим на результат factor_temperature |
Выведем класс созданного объекта.
class(factor_temperature) |
Добавлю, что количество элементов в каждой из категорий можно посмотреть с помощью функции summary().
summary(factor_temperature) |
Датафрейм
Датафрейм в R выполняет примерно ту же функцию, что и в Питоне. С помощью функции data.frame() создадим простой датафрейм, гда параметрами будут названия столбцов, а аргументами — векторы их значений.
df <— data.frame(city = c(‘Москва’, ‘Париж’, ‘Лондон’), population = c(12.7, 2.1, 8.9), country = c(‘Россия’, ‘Франция’, ‘Великобритания’)) df |
Доступ к элементам датафрейма можно получить по индексам строк и столбцов, которые также начинаются с единицы.
# выведем значения первой строки и первого столбца df[1, 1] |
# выведем всю первую строку df[1,] |
# выведем второй столбец df[,2] |
Получить доступ к столбцам можно и так.
Дополнительные пакеты
Как и в Питоне, в R мы можем установить дополнительные пакеты через Anaconda Prompt. Например, установим пакет ggplot2 для визуализации данных. Для этого введем команду
conda install r-ggplot2.
В целом команда установки пакетов для R следующая:
conda install r-<package_name>.
Продемонстрируем работу с этим пакетом с помощью несложного датасета mtcars.
# импортируем библиотеку datasets library(datasets) # загрузим датасет mtcars data(mtcars) # выведем его на экран mtcars |
Теперь импортируем установленную ранее библиотеку ggplot2.
Построим гистограмму по столбцу mpg (miles per galon, расход в милях на галлон топлива). Для построения гистограммы нам потребуется через «+» объединить две функции:
- функцию ggplot(), которой мы передадим наши данные и еще одну функцию aes(), от англ. aesthetics, которая свяжет ось x нашего графика и столбец данных mpg, а также
- функцию geom_histogram() с параметрами bins (количество интервалов) и binwidth (их ширина), которая и будет отвечать за создание гистограммы
# данными будет датасет mtcars, столбцом по оси x — mpg ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg)) + # типом графика будет гистограмма с 10 интервалами шириной 5 миль на галлон каждый geom_histogram(bins = 10, binwidth = 5) |
Примерно также мы можем построить график плотности распределения (density plot). Только теперь мы передадим функции aes() еще один параметр
fill = as.factor(vs), который (предварительно превратив столбец в фактор через as.factor()) позволит разбить данные на две категории по столбцу vs. В этом датасете признак vs указывает на конфигурацию двигателя (расположение цилиндров), v-образное, v-shaped (vs == 0) или рядное, straight (vs == 1).
Кроме того, для непосредственного построения графика мы будем использовать новую функцию geom_density() с параметром alpha, отвечающим за прозрачность заполнения пространства под кривыми.
ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg, fill = as.factor(vs))) + geom_density(alpha = 0.3) |
Дополнительно замечу, что к столбцам датафрейма можно применять множество различных функций, например, рассчитать среднее арифметическое или медиану с помощью несложных для запоминания mean() и median().
mean(mtcars$mpg) median(mtcars$mpg) |
Кроме того, мы можем применить уже знакомую нам функцию summary(), которая для количественного столбца выдаст минимальное и максимальное значения, первый (Q1) и третий (Q2) квартили, а также медиану и среднее значение.
Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. 10.40 15.43 19.20 20.09 22.80 33.90 |
В файле ниже содержится созданный нами код на R.
Вернемся к основной теме занятия.
Подробнее про Anaconda
Conda
Программа conda, как уже было сказано, объединяет в себе систему управления пакетами (как pip) и, кроме того, позволяет создавать окружения.
Идея виртуального окружения (virtual environment) заключается в том, что если в рамках вашего проекта вы, например, используете определенную версию библиотеки Numpy и установка более ранней или более поздней версии приведет к сбоям в работе вашего кода, хорошим решением была бы изоляция нужной версии Numpy, а также всех остальных используемых вами библиотек. Именно для этого и нужно виртуальное окружение.
Рассмотрим, как мы можем устанавливать пакеты и создавать окружения через Anaconda Prompt и через Anaconda Navigator.
Anaconda Prompt
Про пакеты. По аналогии с pip, установленные (в текущем окружении) пакеты можно посмотреть с помощью команды
conda list.
Установить пакет можно с помощью команды
conda install <package_name>. Обновить пакет можно через
conda update <package_name>. Например, снова попробуем установить Numpy. о
Про окружения. По умолчанию мы работаем в базовом окружении (base environment). Посмотреть, какие в целом установлены окружения можно с помощью команды
conda info —envs.
Как вы видите, пока у нас есть только одно окружение. Давайте создадим еще одно виртуальное окружение и назовем его, например, waterfall.
Введите команду
conda create —name waterfall.
Введем две команды
- conda activate waterfall для активации нового окружения
- conda list для того, чтобы посмотреть установленные в нем пакеты
Как вы видите, в новом окружении нет ни одного пакета. Введем
conda search seaborn, чтобы посмотреть какие версии этого пакета доступны для скачивания.
Скачаем этот пакет через
conda install seaborn. Проверим установку с помощью
conda list.
Как вы видите, помимо seaborn было установлено множество других необходимых для работы пакета библиотек. Вернуться в базовое окружение можно с помощью команд
conda activate base или
conda deactivate.
Импорт модулей и переменная path
На прошлом занятии мы научились импортировать собственный модуль в командной строке Windows (cmd).
Посмотрим, отличается ли содержимое списка path для двух установленных версий Питона. Для этого в командной строке Windows и в Anaconda Prompt перейдем в интерактивный режим с помощью
python. Затем введем
Как мы видим, пути в переменной path будут отличаться и это нужно учитывать, если мы хотим локально запускать собственные модули.
Anaconda Navigator
Запускать программы, управлять окружениями и устанавливать необходимые библиотеки можно также через Anaconda Nagivator. На вкладке Home вы видите программы, которые можно открыть (launch) или установить (install) для текущего окружения.
На вкладке Environments отображаются созданные нами окружения (в частности, окружение waterfall, которое мы создали ранее) и содержащиеся в них пакеты.
В целом интерфейс интуитивно понятен, и так как мы уже познакомились с принципом создания окружений и установки в них дополнительных пакетов, уверен, работа с Anaconda Navigator сложностей не вызовет.
Прежде чем завершить, обратимся к еще одной программе для интерактивного программирования JupyterLab.
JupyterLab
JupyterLab — расширенная версия Jupyter Notebook, которая также входит в дистрибутив Anaconda. Запустить эту программу можно через Anaconda Navigator или введя команду
jupyter lab в Anaconda Prompt.
После запуска вы увидите вкладку Launcher, в которой можно создать новый ноутбук (Notebook) на Питоне или R, открыть консоль (Console) на этих языках, а также создать файлы в различных форматах (Other). Слева вы видите список папок компьютера.
В разделе Console нажмем на Python 3 (ipykernel). Введем несложный код (см. ниже) и исполним его, нажимая Shift + Enter.
Как вы видите, здесь мы можем писать код на Питоне так же, как мы это делали в командной строке Windows на прошлом занятии. Закроем консоль.
В файловой системе слева мы можем открывать уже созданные ноутбуки. Например, откроем ноутбук на R rprogramming.ipynb.
В левом меню на второй сверху вкладке мы видим открытые горизонтальные вкладки (Launcher и rprogramming.ipynb), а также запущенные ядра (kernels).
Консольные ядра (Console 1 и Console 2) можно открыть (по сути, мы снова запустим консоль).
Две оставшиеся вертикальные вкладки открывают доступ к автоматическому оглавлению (content) и расширениям (extensions).
Вкладки Run и Kernel в верхнем меню JupyterLab в целом аналогичны вкладкам Cell и Kernel в JupyterNotebook.
Подведем итог
На сегодняшнем занятии мы познакомились с программой Jupyter Notebook, а также изучили дистрибутив Anaconda, в состав которого входит эта программа.
Говоря о программе Jupyter Notebook, мы узнали про возможности работы с ячейками и ядром программы. Кроме того, мы познакомились с языком разметки Markdown и написанием формул с помощью языка верстки LaTeX.
После этого мы установили ядро для программирования на R и рассмотрели основы этого языка.
При изучении дистрибутива Anaconda мы позникомились с системой conda и попрактиковались в установке библиотек и создании окружений через Anaconda Prompt и Anaconda Navigator.
Наконец мы узнали про особенности программы JupyterLab.
Вопросы для закрепления
Вопрос. Что такое Anaconda?
Посмотреть правильный ответ
Ответ: Anaconda — это дистрибутив Питона (с репозиторием пакетов) и отдельной программой управления окружениями и пакетами conda. Пользователь может взаимодействовать с этой программой через терминал (Anaconda Prompt) и графический интерфейс (Anaconda Navigator).
Помимо этого, в дистрибутив Anaconda входят, среди прочих, программы Jupyter Notebook и JupyterLab.
Вопрос. Какой тип ячеек доступен в Jupyter Notebook?
Посмотреть правильный ответ
Ответ: в Jupyter Notebook есть два основных типа ячеек — ячейки для написания кода (в частности, на Питоне и R) и текстовые ячейки, поддерживающие Markdown и LaTeX.
Вопрос. Для чего нужно виртуальное окружение?
Посмотреть правильный ответ
Ответ: виртуальное окружение (virtual environment) позволяет установить и изолировать определенные версии Питона и его пакетов. Таким образом код, написанный с учетом конкретной версии Питона и дополнительных библиотек, исполнится без ошибок.
Ответы на вопросы
Вопрос. Можно ли исполнить код на R в Google Colab?
Ответ. Да, это возможно. Причем двумя способами.
Способ 1. Откройте ноутбук. Введите и исполните команду
%load_ext rpy2.ipython. В последующих ячейках введите
%R, чтобы в этой же строке написать код на R или
%%R, если хотите, чтобы вся ячейка исполнилась как код на R (так называемые магические команды).
В этом случае мы можем исполнять код на двух языках внутри одного ноутбука.
# введем магическую команду, которая позволит программировать на R %load_ext rpy2.ipython |
# команда %%R позволит Colab распознать ячейку как код на R %%R # кстати, числовой вектор можно создать просто с помощью двоеточия x <— 1:10 x |
# при этом ничто не мешает нам продолжать писать код на Питоне import numpy as np np.mean([1, 2, 3]) |
Приведенный выше код можно найти в дополнительных материалах⧉ к занятию.
Способ 2. Если вы хотите, чтобы весь код исполнялся на R (как мы это делали в Jupyter Notebook), создайте новый ноутбук используя одну из ссылок ниже:
- https://colab.research.google.com/#create=true&language=r⧉
- https://colab.to/r⧉
Теперь, если вы зайдете на вкладку Runtime → Change runtime type, то увидите, что можете выбирать между Python и R.
Выведем версию R в Google Colab.
‘R version 4.2.0 (2022-04-22)’ |
Посмотреть на установленные пакеты можно с помощью
installed.packages(). Созданный ноутбук Google Colab на R доступен по ссылке⧉.
Вопрос. Очень медленно загружается Anaconda. Можно ли что-то сделать?
Ответ. Можно работать через Anaconda Prompt, эта программа быстрее графического интерфейса Anaconda Navigator.
Кроме того, можно использовать дистрибутив Miniconda⧉, в который входит conda, Питон и несколько ключевых пакетов. Остальные пакеты устанавливаются вручную по мере необходимости.
Вопрос. Разве Jupyter не должен писаться через i, как Jupiter?
Ответ. Вы правы в том плане, что название Jupyter Notebook происходит не от планеты Юпитер, которая по-английски как раз пишется через i (Jupiter), а представляет собой акроним от названий языков программирования Julia, Python и R.
При этом, как утверждают разработчики⧉, слово Jupyter также отсылает к тетрадям (notebooks) Галилея, в которых он, в частности, документировал наблюдение за лунами Юпитера.
Вопрос. В каких еще программах можно писать код на Питоне и R?
Ответ. Таких программ несколько. Довольно удобно пользоваться облачным решением Kaggle. Там можно создавать как скрипты (scripts, в том числе RMarkdown Scripts), так и ноутбуки на Питоне и R. Подробнее можно почитать в документации⧉ на их сайте.
Вопрос. Можно ли создать виртуальное окружение каким-либо другим способом помимо программы conda?
Ответ. Да, можно. Вот здесь⧉ есть хорошая видео-инструкция.
Вот коротко какие шаги нужно выполнить.
Вначале убедитесь, что у вас уже установлен Питон. В нем по умолчанию содержится модуль venv, который как раз предназначен для создания виртуального окружения.
Шаг 1. Создайте папку с вашим проектом, например, пусть это будет папка webapp для веб-приложения на популярном фреймворке для Питона Django.
Шаг 2. В командной строке перейдите в папку webapp.
Затем введите команду для создания виртуального окружения.
По сути мы говорим Питону создать окружение djenv (название может быть любым) с помощью модуля venv. Переключатель (flag или switch)
-m подсказывает питону, что venv — это модуль, а не файл.
После выполнения этой команды создается папка djenv виртуального окружения.
Шаг 3. Активируем это виртуальное окружение следующей командой.
Здесь мы обращаемся к файлу activate внутри папки Scripts. Как вы видите, название окружения появилось слева от пути к папке.
Теперь через pip можно устанавливать пакеты, которые будут «видны» только внутри виртуального окружения djenv.
Шаг 4. Выйти из этого виртуального окружения можно с помощью команды deactivate. Если вам нужно удалить окружение, сначала деактивируйте его, а затем вручную удалите соответствующую папку.
На следующем занятии мы поговорим про такую важную тему, как регулярные выражения.
Jupyter Notebook
The Jupyter notebook is a web-based notebook environment for interactive
computing.
Maintained versions
We maintain the two most recently released major versions of Jupyter Notebook, Notebook v5 and Classic Notebook v6. After Notebook v7.0 is released, we will no longer maintain Notebook v5. All Notebook v5 users are strongly advised to upgrade to Classic Notebook v6 as soon as possible.
The Jupyter Notebook project is currently undertaking a transition to a more modern code base built from the ground-up using JupyterLab components and extensions.
There is new stream of work which was submitted and then accepted as a Jupyter Enhancement Proposal (JEP) as part of the next version (v7): https://jupyter.org/enhancement-proposals/79-notebook-v7/notebook-v7.html
There is also a plan to continue maintaining Notebook v6 with bug and security fixes only, to ease the transition to Notebook v7: jupyter/notebook-team-compass#5 (comment)
Notebook v7
The next major version of Notebook will be based on:
- JupyterLab components for the frontend
- Jupyter Server for the Python server
This represents a significant change to the jupyter/notebook
code base.
To learn more about Notebook v7: https://jupyter.org/enhancement-proposals/79-notebook-v7/notebook-v7.html
Classic Notebook v6
Maintainance and security-related issues are now being addressed in the 6.4.x
branch.
A 6.5.x
branch will be soon created and will depend on nbclassic
for the HTML/JavaScript/CSS assets.
New features and continuous improvement is now focused on Notebook v7 (see section above).
If you have an open pull request with a new feature or if you were planning to open one, we encourage switching over to the Jupyter Server and JupyterLab architecture, and distribute it as a server extension and / or JupyterLab prebuilt extension. That way your new feature will also be compatible with the new Notebook v7.
Jupyter notebook, the language-agnostic evolution of IPython notebook
Jupyter notebook is a language-agnostic HTML notebook application for
Project Jupyter. In 2015, Jupyter notebook was released as a part of
The Big Split™ of the IPython codebase. IPython 3 was the last major monolithic
release containing both language-agnostic code, such as the IPython notebook,
and language specific code, such as the IPython kernel for Python. As
computing spans across many languages, Project Jupyter will continue to develop the
language-agnostic Jupyter notebook in this repo and with the help of the
community develop language specific kernels which are found in their own
discrete repos.
- The Big Split™ announcement
- Jupyter Ascending blog post
Installation
You can find the installation documentation for the
Jupyter platform, on ReadTheDocs.
The documentation for advanced usage of Jupyter notebook can be found
here.
For a local installation, make sure you have
pip installed and run:
Usage — Running Jupyter notebook
Running in a local installation
Launch with:
Running in a remote installation
You need some configuration before starting Jupyter notebook remotely. See Running a notebook server.
Development Installation
See CONTRIBUTING.md
for how to set up a local development installation.
Contributing
If you are interested in contributing to the project, see CONTRIBUTING.md
.
Community Guidelines and Code of Conduct
This repository is a Jupyter project and follows the Jupyter
Community Guides and Code of Conduct.
Resources
- Project Jupyter website
- Online Demo at jupyter.org/try
- Documentation for Jupyter notebook
- Korean Version of Installation
- Documentation for Project Jupyter [PDF]
- Issues
- Technical support — Jupyter Google Group
Jupyter Notebook — это среда разработки для написания и выполнения кода Python. Некоммерческая организация Project Jupyter с открытым исходным кодом поддерживает программное обеспечение. Он состоит из последовательности ячеек, каждая из которых содержит небольшой пример кода или документацию в формате Markdown. Разработчики могут выполнить ячейку и увидеть ее вывод сразу под кодом. Гениальный дизайн создает мгновенную петлю обратной связи, позволяя программисту запускать свой код и вносить в него соответствующие изменения.
Ячейки Jupyter Notebook также поддерживают аннотации, аудиофайлы, видео, изображения, интерактивные диаграммы и многое другое. Это еще одно важное преимущество программного обеспечения; вы можете рассказать историю с вашим кодом. Читатели могут видеть шаги, которые вы выполнили, чтобы получить результат.
Вы можете импортировать пакеты Python, такие как pandas, NumPy или TensorFlow, прямо в Блокнот.
Jupyter Notebook – это веб-оболочка для Ipython (ранее называлась IPython Notebook). Это веб-приложение с открытым исходным кодом, которое позволяет создавать и обмениваться документами, содержащими живой код, уравнения, визуализацию и разметку.
Первоначально IPython Notebook ограничивался лишь Python в качестве единственного языка. Jupyter Notebook позволил использовать многие языки программирования, включая Python, R, Julia, Scala и F#.
Установка/инсталляция Jupyter Notebook — pip3 install jupyter
Install Jupyter Notebook на Ubuntu 20.14
Установка классического блокнота Jupyter без виртуальной среды осуществляется очень просто. Для этого необходимо запустить 2 команды:
pip install notebook
После этого на вашей рабочей машине установится jupyter notebook. Теперь его необходимо запустить командой:
jupyter notebook
Откроется окно по адресу localhost:8888/
Install Jupyter Notebook на Windows
Аналогично без виртуальной среды блокнот Jupyter можно установить и на винду. Запускаем команду:
pip install notebook
и после завершения установки запускаем команду:
jupyter-notebook
Установка Jupyter Notebook в Docker через Docker-Compose
todo
Установка Jupyter Notebook через virtual env на Windows
Создаем директорию проекта, например:
D:#python##envjupyter
Далее в этой директории создаем виртуальную среду с помощью команды:
python3 -m venv venv
или
python -m venv venv
Далее переходим в директорию D:#python##envjupytervenvScripts и запускаем activate. Должна активироваться среда venv:
D:#python##envjupytervenvScripts>activate (venv) D:#python##envjupytervenvScripts>
Далее запустите в активированной виртуальной среде venv установку jupyter notebook:
(venv) D:#python##envjupytervenvScripts>pip install notebook Collecting notebook Using cached notebook-6.4.10-py3-none-any.whl (9.9 MB) Collecting jupyter-client>=5.3.4 Downloading jupyter_client-7.2.2-py3-none-any.whl (130 kB) |████████████████████████████████| 130 kB 128 kB/s Collecting nbconvert>=5 Using cached nbconvert-6.4.5-py3-none-any.whl (561 kB) ..... ..... ..... Installing collected packages: ..... Successfully installed .....
После завершения установки внутри venv нужно подняться в корень директории jupyter и запустить jupyter-notebook:
(venv) D:#python##envjupytervenvScripts>cd .. (venv) D:#python##envjupytervenv>cd .. (venv) D:#python##envjupyter>jupyter-notebook [I 06:14:46.674 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: D:#python##envjupyter [I 06:14:46.674 NotebookApp] Jupyter Notebook 6.4.10 is running at: [I 06:14:46.678 NotebookApp] http://localhost:8888/?token=443ed7feca651de8172b6f043ea0cf42645ddbc406a784d1 [I 06:14:46.681 NotebookApp] or http://127.0.0.1:8888/?token=443ed7feca651de8172b6f043ea0cf42645ddbc406a784d1 [I 06:14:46.682 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation). [C 06:14:46.835 NotebookApp] To access the notebook, open this file in a browser: file:///C:/Users/Ivan/AppData/Roaming/jupyter/runtime/nbserver-1952-open.html Or copy and paste one of these URLs: http://localhost:8888/?token=443ed7feca651de8172b6f043ea0cf42645ddbc406a784d1 or http://127.0.0.1:8888/?token=443ed7feca651de8172b6f043ea0cf42645ddbc406a784d1
Выглядит это так:
Откроется окно в браузере:
Повторный запуск среды осуществляется из виртуальной среды (сначала ее нужно активировать).
Установка Jupyter Notebook через virtual env на Ubuntu 20.14
# Создаем директорию проекта с виртуальной средой mkdir jupyter-env # Переходим внутрь проекта cd jupyter-env # Создаем среду myenv python3 -m venv myenv # Активируем среду source myenv/bin/activate # Запускаем установку jupyter pip install notebook # Запускаем jupyter notebook внутри venv jupyter notebook
Как устроен Jupyter Notebook. Как работает Jupyter Notebook
Общий вид Jupyter Notebook
Сначала пользователь взаимодействует с браузером, после чего на сервер Notebook отправляется запрос. Это может быть запрос HTTP или WebSocket.
Если код пользователя должен быть выполнен, сервер ноутбука отправляет его ядру (kernel) в сообщениях ZeroMQ. Ядро возвращает результаты выполнения.
Затем сервер Notebook возвращает пользователю HTML-страницу. Когда пользователь сохраняет документ, он отправляется из браузера на сервер Notebook. Сервер сохраняет его на диске в виде файла JSON с .ipynb расширением. Этот файл блокнота содержит код, выходные данные и примечания в формате markdown.
Ядро (Kernel) ничего не знает о документе блокнота: оно просто получает отправленные ячейки кода для выполнения, когда пользователь запускает их.
Блокноты Jupyter — это структурированные данные, которые представляют ваш код, метаданные, контент и выходные данные.
IPython Kernel (Ядро IPython)
Когда мы обсуждаем IPython, мы говорим о двух основных ролях:
- Terminal IPython как знакомый REPL.
- Ядро IPython, которое обеспечивает вычисления и связь с внешними интерфейсами, такими как ноутбук.
REPL – это форма организации простой интерактивной среды программирования в рамках средств интерфейса командной строки (REPL, от англ. Read-Eval-Print-Loop — цикл «чтение — вычисление — вывод»), которая поставляется вместе с Python. Чтобы запустить IPython, просто выполните команду ipython из командной строки/терминала.
Terminal IPython
Когда вы набираете ipython, вы получаете исходный интерфейс IPython, работающий в терминале. Он делает что-то вроде этого (упрощенная модель):
while True: code = input(">>> ") exec(code)
Эту модель часто называют REPL или Read-Eval-Print-Loop.
IPython Kernel
Все остальные интерфейсы — notebook, консоль Qt, ipython console в терминале и сторонние интерфейсы — используют Python Kernel.
Python Kernel — это отдельный процесс, который отвечает за выполнение пользовательского кода и такие вещи, как вычисление possible completions (возможных завершений). Внешние интерфейсы, такие как блокнот или консоль Qt, взаимодействуют с ядром IPython, используя сообщения JSON, отправляемые через сокеты ZeroMQ (протокол, используемый между интерфейсами и ядром IPython).
Основной механизм выполнения ядра используется совместно с терминалом IPython:
Jupyter Lab
Проект Jupyter приобрел большую популярность не только среди специалистов по данным, но и среди инженеров-программистов. На тот момент Jupyter Notebook был предназначен не только для работы с ноутбуком, поскольку он также поставлялся с веб-терминалом, текстовым редактором и файловым браузером. Все эти компоненты не были объединены вместе, и сообщество пользователей начало выражать потребность в более интегрированном опыте.
На конференции SciPy 2016 был анонсирован проект JupyterLab. Он был описан как естественная эволюция интерфейса Jupyter Notebook.
Кодовая база Notebook устарела, и ее становилось все труднее расширять. Стоимость поддержки старой кодовой базы и реализации новых функций поверх нее постоянно росла.
Разработчики учли весь опыт работы с Notebook в JupyterLab, чтобы создать надежную и чистую основу для гибкого интерактивного взаимодействия с компьютером и улучшенного пользовательского интерфейса.
Ценность Jupyter Notebook/JupyterLab для аналитиков данных
Разница между профессией data analyst/data scientist от разработки ПО заключается в отсутствии чёткого ТЗ на старте. Правильная постановка задачи в сфере анализа данных — это уже половина решения.
Первым этапом производится детальный анализ Initial Data (исходных данных) или Exploratory Data Analysis (Разведочный анализ данных), затем выдвигается одна или несколько гипотез. Эти шаги требуют значительных временных ресурсов.
Поэтому, понимание, как организовать процесс разработки (что нужно делать в первую очередь и чем можно будет пренебречь или исключить), начинает приходить во время разработки.
Исходя из этих соображений тратить силы на скурпулёзное и чистый код, git и т.д. бессмысленно — в первую очередь становится важным быстро создавать прототипы решений, ставить эксперименты над данными. Помимо этого, достигнутые результаты и обнаруженные инсайты или необычные наблюдения над данными приходится итерационно презентовать коллегам и заказчикам (внешним или внутренним). Jupyter Notebook или JupyterLab позволяет выполнять описанные задачи с помощью доступного функционала без дополнительных интеграций:
По факту, JupyterLab — это лабораторный журнал 21 века с элементами интерактивности, в котором вы можете оформить результаты работы с данными в формате markdown с использованием формул из latex. Также в JupyterLab можно писать и запускать код, вставлять в отчет картинки, отрисовывать графики, таблицы, дашборды.
Установка JupyterLab на Ubuntu 20.14
Установка производится одной командой
pip install jupyterlab
После инсталляции запустите команду
jupyter-lab
И откроется интерфейс:
Установка JupyterLab на Windows
Инсталляция и запуск на винде производится аналогично, как и на Ubuntu, командой pip instal jupyterlab
.
В чем разница между Jupyter Notebook и JupyterLab?
Jupyter Notebook — это интерактивная вычислительная среда с веб-интерфейсом для создания документов Jupyter Notebook. Он поддерживает несколько языков, таких как Python (IPython), Julia, R и т.д., и в основном используется для анализа данных, визуализации данных и дальнейших интерактивных исследовательских вычислений.
JupyterLab — это пользовательский интерфейс нового поколения, включая ноутбуки. Он имеет модульную структуру, в которой вы можете открыть несколько записных книжек или файлов (например, HTML, Text, Markdowns и т.д.) в виде вкладок в одном окне. Он предлагает больше возможностей, подобных IDE.
Новичку я бы посоветовал начать с Jupyter Notebook, так как он состоит только из файлового браузера и представления редактора (Notebook). Это проще в использовании. Если вам нужны дополнительные функции, переключитесь на JupyterLab. JupyterLab предлагает гораздо больше функций и улучшенный интерфейс, который можно расширить с помощью расширений: JupyterLab Extensions.
Начиная с версии 3.0, JupyterLab также поставляется с визуальным отладчиком, который позволяет интерактивно устанавливать точки останова, переходить к функциям и проверять переменные.
JupyterLab — это совершенно фантастический инструмент как для создания plotly фигур, так и для запуска полных приложений Dash как встроенных, в виде вкладок, так и внешних в браузере.
Основы работы и обзор функциональности Jupyter Notebook
Из чего состоит Jupiter Notebook
Если щелкнуть по файлу с расширением .ipynb, откроется страница с Jupiter Notebook.
Отображаемый Notebook представляет собой HTML-документ, который был создан Jupyter и IPython. Он состоит из нескольких ячеек, которые могут быть одного из трех типов:
- Сode (активный программный код),
- Markdown (текст, поясняющий код, более развернутый, чем комментарий),
- Raw NBConvert (пассивный программный код).
Jupyter запускает ядро IPython для каждого Notebook.
Ячейки, содержащие код Python, выполняются внутри этого ядра и результаты добавляются в тетрадку в формате HTML.
Двойной щелчок по любой из этой ячеек позволит отредактировать ее. По завершении редактирования содержимого ячейки, нажмите Shift + Enter, после чего Jupyter/IPython проанализирует содержимое и отобразит результаты.
Если выполняемая ячейка является ячейкой кода, это приведет к выполнению кода в ячейке и отображению любого вывода непосредственно под ним. На это указывают слова «In» и «Out», расположенные слева от ячеек.
Магические функции Jupiter Notebook
Все magic-функции (их еще называют magic-командами) начинаются
- со знака %, если функция применяется к одной строке,
- и %%, если применяется ко всей ячейке Jupyter.
Чтобы получить представление о времени, которое потребуется для выполнения функции, приведенной выше, мы воспользуемся функцией %timeit.
%timeit
%timeit – это magic-функция, созданная специально для работы с тетрадками Jupyter. Она является полезным инструментом, позволяющим сравнить время выполнения различных функций в одной и той же системе для одного и того же набора данных.
%matplotlib inline
%matplotlib inline позволяет выводит графики непосредственно в тетрадке.
На экранах с высоким разрешением типа Retina графики в тетрадках Jupiter по умолчанию выглядят размытыми, поэтому для улучшения резкости используйте
%config InlineBackend.figure_format = 'retina'
после %matplotlib inline.
jupyter markdown
туду
jupyter server
туду
jupyter config
туду
jupyter hub
JupyterHub: позволяет предоставлять нескольким пользователям (группам сотрудников) доступ к Notebook и другим ресурсам. Это может быть полезно для студентов и компаний, которые хотят, чтобы группа (группы) имела доступ к вычислительной среде и ресурсам и использовала их без необходимости установки и настройки. Управление которыми могут осуществлять системные администраторы. Доступ к отдельным блокнотам и JupyterLab можно получить через Hub. Hub может работать в облаке или на собственном оборудовании группы.
jupyter команды
туду
pycharm jupyter
туду
Виджеты Jupyter
Виджеты можно использовать для интерактивных элементов в блокнотах (например, ползунок).
Jupyter Widgets — это событийные объекты Python, которые имеют представление в браузере, часто в виде элемента управления, такого как ползунок, текстовое поле и т. д.
Вы можете использовать виджеты для создания интерактивных графических интерфейсов для своих ноутбуков.
Вы также можете использовать виджеты для синхронизации информации с сохранением состояния и без сохранения состояния между Python и JavaScript.
Чтобы использовать структуру виджетов, вам необходимо импортировать файлы ipywidgets
.
Почему отображение одного и того же виджета дважды работает?
Виджеты представлены в бэкенде одним объектом. Каждый раз, когда отображается виджет, во внешнем интерфейсе создается новое представление того же объекта. Эти представления называются представлениями.
Несколько самых популярных виджетов:
Чтобы начать использовать библиотеку, нам нужно установить расширение ipywidgets. Для pip это будет двухэтапный процесс:
- установить и
- включить
pip install ipywidgets jupyter nbextension enable --py widgetsnbextension
Tips & Tricks / Советы, рекомендации и фишки при работе с Jupyter Notebook
todo
Подборка видео по Jupyter
Как использовать Jupyter (ipython-notebook) на 100%
Jupyter Notebook Tutorial (Eng)
- 00:00 Introduction
- 01:35 Jupyter notebook example
- 04:11 Installing Python and Jupyter notebooks
- 09:23 Launching Jupyter notebooks
- 11:08 Basic notebook functionality
- 20:58 The kernel, and variables
- 28:38 Other notebook functionality
- 34:45 The menu
- 35:52 Jupyter notebook keyboard shortcuts
- 36:57 Load and display data using pandas
- 40:33 Using terminal commands inside a Jupyter notebook
- 42:30 Jupyter notebook magic commands
- 45:07 Other features outside of the notebooks
- 46:41 Shutting down Jupyter notebooks
- 48:02 Jupyter notebook extensions and other libraries
- 52:47 Conclusion, and thank you
Jupyterlab — STOP Using Jupyter Notebook! Here’s the Better Tool
…
Contents
- Prerequisite: Python
- Installing Jupyter using Anaconda and conda
- Alternative for experienced Python users: Installing Jupyter with pip
This information explains how to install the Jupyter Notebook and the IPython
kernel.
Prerequisite: Python¶
While Jupyter runs code in many programming languages, Python is
a requirement (Python 3.3 or greater, or Python 2.7) for installing
the Jupyter Notebook.
We recommend using the Anaconda
distribution to install Python and Jupyter. We’ll go through its installation
in the next section.
Installing Jupyter using Anaconda and conda¶
For new users, we highly recommend installing Anaconda. Anaconda conveniently
installs Python, the Jupyter Notebook, and other commonly used packages for
scientific computing and data science.
Use the following installation steps:
-
Download Anaconda. We recommend
downloading Anaconda’s latest Python 3 version (currently Python 3.5). -
Install the version of Anaconda which you downloaded, following the
instructions on the download page. -
Congratulations, you have installed Jupyter Notebook. To run the notebook:
See Running the Notebook for more details.
Alternative for experienced Python users: Installing Jupyter with pip¶
Important
Jupyter installation requires Python 3.3 or greater, or
Python 2.7. IPython 1.x, which included the parts that later became Jupyter,
was the last version to support Python 3.2 and 2.6.
As an existing Python user, you may wish to install Jupyter using Python’s
package manager, pip, instead of Anaconda.
First, ensure that you have the latest pip;
older versions may have trouble with some dependencies:
pip3 install --upgrade pip
Then install the Jupyter Notebook using:
(Use pip
if using legacy Python 2.)
Congratulations. You have installed Jupyter Notebook. See
Running the Notebook for more details.
Three Ways to Run Jupyter In Windows
The «Pure Python» Way
Make your way over to python.org, download and install the latest version (3.5.1 as of this writing) and make sure that wherever you install it, the directory containing python.exe is in your system PATH environment variable. I like to install it in the root of my C: drive, e.g. C:Python35
, so my PATH contains that directory.
Once that’s installed, you’ll want to create a virtual environment, a lightweight, disposable, isolated python installation where you can experiment and install 3rd party libraries without affecting your «main» installation. To do this, open up a Powershell window, and enter the following commands (where «myenv
» is the name of the virtualenv
we’re going to create, you can use any name you like for this):
PS C:> python -m venv myenv
PS C:> myenvScriptsactivate
Then, let’s install jupyter
and start up a notebook:
PS C:> pip install jupyter
PS C:> jupyter notebook
Incidentally, if you get a warning about upgrading pip, make sure to use the following incantation to upgrade (to prevent an issue on windows where pip is unable to upgrade its own executable in-place):
PS C:> python -m pip install --upgrade pip
Advantages: Uses «pure» python, official tools, and no external dependencies. Well supported, with plenty of online documentation and support communities.
Disadvantages: While many popular data analysis or scientific python libraries can be installed by pip on windows (including Pandas and Matplotlib), some (for example SciPy) require a C compiler and the presence of 3rd party C libraries on the system which are difficult to install on Windows.
Who is it for? Python users comfortable with the command line and the tools that ship with Python itself.
The Python Distributions
Because of the difficulty mentioned above in getting packages like SciPy installed on Windows, a few commercial entities have put together pre-packaged Python «distributions» that contain most, if not all, of the commonly used libraries for data analysis and/or scientific computing.
Anaconda is an excellent option for this. Download their Python 3.5 installer for Windows, run it, and in your Start menu you’ll have a bunch of neat new tools, including an entry for Jupyter Notebook. Click to start it up and it’ll launch in the background and open up your browser to the notebook console. It doesn’t get any easier than that.
Advantages: Simplest, fastest way to get started and it comes with probably everything you need for your scientific computing projects. And anything it doesn’t ship with you can still instalAl via its built in conda package manager.
Disadvantages: No virtualenv support, although the conda package manager provides very similar functionality with the conda create command. Relies on a commercial 3rd party for support.
Who is it for? People who want the quickest, easiest way to get Jupyter notebook up and running (IE, most people).
Docker
Docker is a platform for running software in «containers
«, or self-contained, isolated processes. While it may sound similar in concept to python virtual environments, Docker containers are an entirely different kind of technology offering vast flexibility and power. Don’t let the flexibility and power and confusing terminology put you off though — Docker can be easy to get up and running on your PC and has some advantages of its own with respect to Python and Jupyter
.
To get started on Windows, download the Docker Toolbox, which contains the tools you need to get up and running. Run the installer and make sure the checkbox to install Virtualbox is checked if you don’t already have Virtualbox or another virtualization platform (like VMWare Workstation
) installed.
Once installed, you’ll have a «Docker Quickstart Terminal» shortcut in your Start Menu. Double click that shortcut and it will create your first Docker engine for you and set up everything you need automatically. Once you see a prompt in the terminal, you can use the docker run command to run Docker «images», which you can think of as pre-packaged bundles of software that will be automatically downloaded from the Docker Hub when you run them. There are many images on Docker Hub that offer Jupyter
, including the official Jupyter Notebook
image, and Anaconda itself if you want the full SciPy stack.
To run just the official Jupyter Notebook
image in your Docker engine, type the following into the Docker Quickstart Terminal:
$ docker run --rm -it -p 8888:8888 -v "$(pwd):/notebooks" jupyter/notebook
After all the image’s «layers» are downloaded, it will start up. Make a note of the IP address listed in the terminal (for example, 192.168.99.100
), and point your browser at that IP address, port 8888
(e.g. http://192.168.99.100:8888
) and you’ll see the familiar Jupyter console
, with both Python 2
and Python 3
kernels available.
Advantages: Use the flexibility and power of Docker! Honestly one of my favorite things about Docker is thinking of it as an open software distribution platform for things like the SciPy
stack that are hard to install.
Disadvantages: Grapple with the flexibility and power of Docker! There are quite a few «gotchas» to be aware of when dealing with Docker, such as immutable containers, data volumes, arcane commands, and rapidly developing, occasionally buggy tooling.